Projetos de biogás, biometano e biofertilizante podem obter certificados de ativos ambientais que reconhecem a redução de emissões de gases de efeito estufa, a geração de energia renovável e outros benefícios ambientais. Entre esses certificados estão os Créditos de Carbono (MDL, Verra, Gold Standard e RenovaBio) e os Certificados de Energia Renovável (I-REC, RECs e GAS-REC). Além dos certificados de ativos ambientais também há outros certificados, entre eles podemos citar: ISO 14001, PROCEL, Inmetro, Conpet e até mesmo Certificados de Destinação Final de Resíduos e Recicla +.